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醫療類申論題 106年 [法醫師] 法醫生物學

第 二 題

下列係某一 STR 基因之一段 DNA 序列,請設計一組可以複製出 STR 片段之黏合溫度(annealing temperature)為 58℃之 PCR 引子(5’-3’),並敘述複製該段 STR DNA 所需的反應材料、最佳濃度與反應條件。(25 分)
5’-AAGGGTATGATAGAACACTTGTCATAGTTTAGAACGAACTAACGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGACAGATTGATAGTTTTTTTTTATCTCACTAAATAGTCTATAGTAAACATTTAATTACCAATATTTGGTGCAATTCTGTCAATGA-3’
📝 此題為申論題

思路引導 VIP

首先需在 STR(AGAT 重複序列)兩側的側翼區尋找適當序列設計引子。利用 Tm ≒ 2°C(A+T) + 4°C(G+C) 公式,尋找 Tm 剛好為 58°C 的序列。正向引子序列與 5' 側翼區相同,反向引子序列則為 3' 側翼區的互補倒轉。接著列出標準的 PCR 試劑及其濃度,並強調法醫 STR 擴增時最終延長步驟(60°C, 30-45分鐘)以促進非模板腺嘌呤(A)附加的重要性。

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【解題關鍵】PCR 引子設計原則(利用 Tm = 2(A+T) + 4(G+C) 公式計算)與法醫 STR 擴增之特殊熱循環條件(需包含最終延長步驟以避免分裂峰)。 【解答】 一、 引子(Primer)設計

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