hce_kmu
109年
普通生物及生化概論
第 78 題
What acts as the nucleophile in the mechanism of nucleotide addition by RNA polymerase?
- A The 5' phosphate of an incoming nucleotide
- B A water molecule
- C A 5' hydroxyl of the template DNA
- D A 3' hydroxyl from the RNA being extended
- E An aspartate in the active site
思路引導 VIP
在核酸合成的過程中，長鏈總是沿著特定的方向延伸。請你想想看，如果要讓現有的長鏈與新進來的單體（monomer）產生化學連結，長鏈的『末端』必須提供哪一種具備孤對電子的官能基，才能主動向外發起攻擊並建立新的化學鍵呢？
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轉錄延伸的化學本質
在 RNA 聚合酶（RNA polymerase）催化轉錄的過程中，反應的核心在於新加入的核苷酸如何與既有的鏈結合。具體來說，是正在延伸中的 RNA 鏈末端之 3' 羥基（3'-OH） 發揮了親核試劑（nucleophile）的作用，去攻擊進入反應中心的核糖核苷三磷酸（rNTP）之 $\alpha$-磷酸基團。這個過程不僅形成了關鍵的 磷酸二酯鍵（phosphodiester bond），釋放出焦磷酸（$PP_i$），也從根本上決定了核酸合成必定是由 $5'$ 端向 $3'$ 端延伸的方向性。
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