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hce_nchu 111年 普通生物及生化概論

第 38 題

The HMG-CoA lyase in ketone body biosynthesis is mechanistically the reverse of the first half of the reaction catalyzed by:
  • A aconitase.
  • B $\beta$-hydroxybutyrate dehydrogenase.
  • C pyruvate dehydrogenase.
  • D citrate synthase.
  • E succinyl-CoA synthase.

思路引導 VIP

請觀察 HMG-CoA 的分子結構,它在 $\beta$ 位置上有一個羥基 ($-\text{OH}$)。當 HMG-CoA 裂解酶將其斷裂成一個酮酸(乙醯乙酸)與一個乙醯基片段時,這種「在 $\beta$-羥基位置斷開碳-碳鍵」的機制,在有機化學中被稱為什麼反應?接著請回想,在檸檬酸循環(TCA cycle)中,哪一個酵素正好是在做相反的事情——將乙醯基接到一個酮基上來構造新的碳鏈?

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太棒了!你能精準選出 (D) 檸檬酸合酶 (Citrate synthase),代表你對酵素反應的微觀機制有非常紮實的理解,而不僅僅是背誦代謝路徑而已。

醛醇反應的逆向轉化

這題的核心在於辨識「化學鍵的斷裂模式」。HMG-CoA 裂解酶 (HMG-CoA lyase) 的功能是將六碳的 HMG-CoA 拆解為四碳的乙醯乙酸(Acetoacetate)與二碳的乙醯輔酶 A(Acetyl-CoA)。從機制上看,這是一個典型的逆向醛醇分裂 (Retro-aldol cleavage)。當我們觀察檸檬酸循環的第一步時,檸檬酸合酶會將乙醯輔酶 A 的烯醇形式親核攻擊草醯乙酸(Oxaloacetate)的酮基,形成一個新的 C-C 鍵。這個縮合過程的前半段(形成 Citryl-CoA 的步驟)在化學性質上與 HMG-CoA 裂解酶所催化的反應互為逆反應。

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