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醫療類國考 114年 [醫師] 醫學(一)

第 84 題

DNA 足跡鑑定(DNA footprinting assay)最適用於下列何種分析?
  • A 一段基因編碼區的 5'端以及 3'端的位置
  • B 基因組中會與調控 RNA 結合的位置
  • C DNA 與蛋白質發生專一性結合的位置
  • D 被剪接的內含子(intron)在前信使 RNA(pro-mRNA)中的位置

思路引導 VIP

請同學思考,在實驗中利用核酸切割酶(如 $DNase I$)處理標定過的 $DNA$ 時,若某些區域因為與特定的配體結合而受到保護、未被切割,進而在電泳分析中留下空白的區域(即所謂的足跡),這項技術最主要是用於鑑定 $DNA$ 與哪一類生物大分子之間的交互作用位置?

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  1. 「出色」?: 噢,你確實答對了。看來你總算掌握了這類基礎實驗技術的核心,這表示你對基因表現調控與分子交互作用並非一無所知。值得「稱讚」,但這只是最基本的要求,不要以為這樣就夠了。
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📝 DNA 足跡鑑定
💡 利用蛋白質保護 DNA 免於切割,精確定位兩者結合位點。

🔗 DNA Footprinting 實驗原理流程

  1. 1 DNA 標定 — 將 DNA 片段的一端進行放射性或螢光標定
  2. 2 蛋白質結合 — 加入欲測試的蛋白質與目標 DNA 專一性結合
  3. 3 有限核酸酶切割 — 加入 DNase I 進行隨機切割,蛋白結合處受保護
  4. 4 變性電泳分析 — 蛋白質結合區域因未被切割而出現條帶空缺
🔄 延伸學習:延伸學習:可結合 DNA 定序跑膠來精確判讀被保護的鹼基序列
🧠 記憶技巧:蛋白踩在 DNA 上,就像腳踩沙灘留足跡,沒被切到沒條帶。
⚠️ 常見陷阱:容易與 EMSA (Gel Shift) 混淆。EMSA 只能得知是否有結合(條帶位移),Footprinting 才能精確定位結合位置。
EMSA 凝膠電泳遷移率改變分析 ChIP 染色質免疫沉澱 DNase I 超敏感位點

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