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調查局三等申論題 115年 [醫學鑑識組] 分子生物學

第 一 題

📖 題組:
請回答下列問題:
📝 此題為申論題,共 2 小題

小題 (一)

何謂 Targeted NGS(tNGS)?(5 分)

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  1. 💡 名詞拆解:NGS 代表次世代定序(Next-Generation Sequencing)。Targeted 代表什麼意思?(靶向、目標)。
  2. 🎯 技術核心:與全基因體定序(WGS)不同,tNGS 在定序前會做什麼事?(利用特異性引子或探針,將我們『感興趣』的特定基因區域、熱點突變進行擴增或捕獲富集)。
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【概念解析】 Targeted NGS(靶向次世代定序,簡稱 tNGS),是一種基於次世代定序(Next-Generation Sequencing, NGS)技術平台的特定基因檢測方法。

  1. 核心定義:有別於對所有遺傳物質進行無差別定序的全基因體定序(WGS),tNGS 在進行定序前,會先利用特異性的探針捕獲(Hybrid Capture)或多重聚合酶連鎖反應擴增(Multiplex PCR Amplicon)技術,將一組特定的目標基因序列(如已知與某種癌症或遺傳疾病高度相關的基因群、外顯子區域或突變熱點)進行富集(Enrichment),隨後僅對這些富集下來的目標片段進行高通量定序。

小題 (二)

請敘述 Targeted NGS(tNGS)與 Metagenomic NGS(mNGS)相較的優缺點。(12 分)

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  1. 💡 名詞釐清:tNGS 剛剛說過是『靶向定序』,只能抓已知目標。那 mNGS(宏基因組/體外基因體次世代定序)是什麼?(是把檢體裡『所有』的核酸,包含宿主、所有細菌、病毒、真菌,全部無差別打碎直接定序)。
  2. ⚖️ 比較:tNGS 的優點(深度高、靈敏度高、成本較低、數據分析容易)。缺點呢?(只能測『已知』設計好的目標,無法發現未知的病原體或基因)。
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【概念解析】 Targeted NGS(靶向次世代定序,tNGS)與 Metagenomic NGS(宏基因組次世代定序,mNGS)是目前臨床分子診斷(特別在感染性疾病病原體鑑定與癌症基因檢測上)的兩大高通量定序策略。兩者在設計理念上有著根本的差異:tNGS 是「撒網捕特定魚」,而 mNGS 是「不分魚蝦全撈」。 以下為 tNGS 相較於 mNGS 的優缺點比較:

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