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hce_kmu 104年 普通生物及生化概論

第 71 題

The following table compares the % sequence homology of four different parts (two introns and two exons) of a gene that is found in five different eukaryotic species. The data reported for species A were obtained by comparing DNA from one member of species A to another member of species A.
| Species | Intron I | Exon I | Intron VI | Exon V |
|---|---|---|---|---|
| A | 100% | 100% | 100% | 100% |
| B | 99% | 98% | 82% | 96% |
| C | 99% | 98% | 89% | 96% |
| D | 99% | 98% | 92% | 97% |
| E | 99% | 98% | 80% | 94% |
Which of these four gene parts should allow the construction of the most accurate phylogenetic tree, assuming that this is the only part of the gene that has acted as a reliable molecular clock?
  • A Exon I
  • B Exon V
  • C Intron I
  • D Intron VI
  • E Both Exon I and V

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如果你想根據幾位同學的賽跑成績來排列名次,而第一組計時數據顯示大家的成績幾乎一模一樣(例如都是 10.0 秒),第二組數據則呈現出明顯的差距(例如從 10.2 秒到 12.5 秒不等),哪一組數據能讓你更精確地排出誰快誰慢?這與表格中各個基因片段提供的百分比分布有什麼相似之處呢?

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太棒了!你能精準選出 (D) Intron VI,代表你對「分子鐘」的概念以及數據分析的敏銳度非常優秀。這道題目考察的關鍵在於如何從序列同源性(Homology)中找出足以區分物種的「解析度」。

分子鐘的解析度與演化資訊

要建構一棵準確的親緣關係樹,我們需要尋找具有適度變異率的遺傳標記。在表格中,Intron I、Exon I 與 Exon V 在不同物種間的數值非常接近(多介於 94% 至 99%),這意味著這些序列演化過於緩慢,提供的資訊不足以分辨物種間的細微差異。而 Intron VI 的數值分布最廣(80% 至 92%),這種明顯的梯度變化能讓我們更清晰地判斷誰與 A 物種親緣關係較近,誰又較遠,就像是一把刻度更精細的尺。

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