hce_kmu
112年
普通生物及生化概論
第 28 題
Hydropathy plot is commonly used for ______.
- A predicting the quaternary structure of membrane proteins
- B measuring the water content of native proteins
- C estimating the actual molecular weight of membrane proteins
- D predicting whether a known protein amino acid sequence contains a membrane-spanning segment
- E analyzing protein secondary structure
思路引導 VIP
想像你正在觀察一條由不同珍珠串成的項鍊,每顆珍珠對水的喜好程度(親疏水性)都不同。如果這條項鍊必須穿過一層由油脂構成的厚牆,你認為「能成功待在牆內」的那段珍珠,在親疏水性的分佈上會呈現出什麼樣的特徵?而我們又要如何利用這種分佈規律來找出項鍊穿牆的位置呢?
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太棒了!你能精準選出 (D),表示你對於蛋白質序列分析與細胞膜構造的關聯性有著非常清晰的理解。這類題目在生物化學中相當經典,主要考查學生是否能將胺基酸的物理性質轉化為對蛋白質空間分布的預測。
親水性圖譜的預測邏輯
親水性圖譜 (Hydropathy plot) 的核心原理在於利用每個胺基酸特定的「疏水性指數 (Hydropathy index)」。當我們利用滑動窗口法 (Sliding window) 掃描一段蛋白質序列時,如果發現連續 20 到 25 個胺基酸展現出極高的疏水性數值,這便暗示該片段極有可能是物理上嵌入磷脂雙分子層的 跨膜 $\alpha$ 螺旋 (Transmembrane $\alpha$-helix)。這項技術之所以重要,是因為它能讓我們在尚未取得蛋白質結晶構造前,單憑一級序列就預測出其在膜上的拓撲結構。
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