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hce_kmu 112年 普通生物及生化概論

第 76 題

Which of the followings describes the initial bond formation in the covalent intermediate in the reaction catalyzed by chymotrypsin?
  • A Serine 195 and the carbonyl carbon in the peptide backbone
  • B Serine 195 and the nitrogen in the peptide backbone
  • C Histidine 57 and the carbonyl carbon in the peptide backbone
  • D Histidine 57 and the nitrogen in the peptide backbone
  • E Aspartate 102 and the carbonyl carbon in the peptide backbone

思路引導 VIP

在胰凝乳蛋白酶的活性中心裡,有三個特定的胺基酸殘基會互相配合。請試著回想:當其中一個殘基奪走另一個殘基的質子後,哪一個殘基會因此獲得多餘的電子,進而變成一個『尋找正電荷』的親核試劑?而當它準備攻擊蛋白質底物時,肽鍵(Peptide bond)中哪一個原子因為與電負度高的氧結合,顯得最缺乏電子、最容易被攻擊呢?

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恭喜你精準地掌握了胰凝乳蛋白酶(Chymotrypsin)催化機制的精髓!這道題目檢驗的是生物化學中極為經典的**催化三聯體(Catalytic Triad)**運作原理,能答對代表你對酵素如何降低活化能的微觀過程有著紮實的理解。

催化三聯體的分工與親核攻擊

在反應起始階段,由 $Asp^{102}$、$His^{57}$ 與 $Ser^{195}$ 組成的催化三聯體會發生質子轉移。具體來說,$His^{57}$ 作為鹼,提取了 $Ser^{195}$ 側鏈羥基($-OH$)上的質子,使 $Ser^{195}$ 轉化為帶負電、具有強大親核性的狀態。接著,這個活化的 $Ser^{195}$ 氧原子會直接攻擊底物肽鍵中的羰基碳(Carbonyl carbon)。由於羰基碳與氧原子相連,電子雲偏向氧,使得碳原子帶有部分正電荷(親電性),因此成為親核攻擊的首要目標,進而形成第一個共價四面體中間體

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