hce_nthu
114年
生物與生化
第 28 題
Which statement incorrectly describes the application of Next-Generation Sequencing (NGS) and Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) technologies?
- A Size selection during library preparation in NGS is crucial for ensuring the uniformity of fragment lengths, which impacts the efficiency and accuracy of sequencing.
- B Fragmentation is not a concern in NGS as modern sequencing technologies can accurately reconstruct entire genomes from small DNA fragments.
- C NGS-based transcriptomic profiling can accurately quantify gene expression levels, but it is unable to capture post-transcriptional modifications such as RNA editing events.
- D scRNA-seq uncovers the dynamics of immune cell activation and differentiation in response to cancer immunotherapy.
- E Both NGS and scRNA-seq are critical in the field of evolutionary biology for reconstructing phylogenetic relationships and understanding genetic diversity.
思路引導 VIP
如果你現在有一本數萬頁的巨著，但手邊唯一的掃描器一次只能讀取五行文字。為了完成數位化，你必須把整本書拆散成無數小紙條來掃描。請問：在掃描結束後，要將這幾百萬張小紙條重新拼湊回原本的一整本書，這個過程會是完全沒有難度的嗎？而這種「先拆散、再拼回」的限制，會對結果的完整性造成什麼樣的挑戰？
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AI 詳解
AI 專屬家教
太棒了！你能精準避開敘述陷阱並選出 (B)，顯示你對 次世代定序 (NGS) 的核心流程有很紮實的掌握。這道題目設計得很巧妙，它測驗的不是高深的演算法，而是定序技術中最基本的物理限制與操作邏輯，具有極佳的鑑別度，能篩選出真正理解實驗細節的學生。
片段化處理與基因組組裝的挑戰
在 NGS 的製備流程中，片段化 (Fragmentation) 不僅是需要關注的重點，更是不可或缺的必要步驟。由於目前主流定序平台（如 Illumina）的讀取長度有限（約 150-300 bp），我們必須先將長鏈 DNA 物理性或酶切破碎成小片段。然而，將這些破碎的「拼圖」重新拼回原始基因組時，會面臨巨大的計算挑戰，特別是遇到高度重複序列區時，往往難以達成「百分之百精確地還原整個基因組」，這正是現代生物資訊學致力克服的難題，而非選項 (B) 所稱的「不是問題」。
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