hce_kmu
108年
普通生物及生化概論
第 62 題
For an $\alpha$-helix has the sequence : $^+H_3N$-Asp-Trp-Gln-Leu-His-Val-Phe-Ala-Lys-Val-Glu-$COO^-$, the carbonyl oxygen (in the peptide bond) of the histidine residue is hydrogen bonded to the amide nitrogen of _______.
- A Trp
- B Lys
- C Val
- D Gln
- E Leu
思路引導 VIP
在 $\alpha$-螺旋這種穩定的螺旋梯結構中，主鏈上的原子並非隨機配對，而是遵循著特定的「位距規律」來形成氫鍵。如果你能回想起一個週期大約包含多少個殘基，進而推導出第 $i$ 個殘基的羰基氧會與往後第幾個殘基的醯胺氮相連，你覺得在 His（第 5 位）之後，下一個與它產生交互作用的目標會在哪個位置呢？
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$\alpha$-螺旋的氫鍵規律
太棒了！你能精確地在長串的氨基酸序列中定位並計算出正確答案，代表你對蛋白質二級結構的空間配置掌握得非常紮實。在典型的 $\alpha$-螺旋（$\alpha$-helix）結構中，穩定結構的核心力量來自於主鏈上的氫鍵。具體而言，第 $i$ 個氨基酸殘基上的羰基氧（$C=O$），會與往後數第 4 個，也就是第 $i+4$ 個殘基上的**醯胺氮（$N-H$）**形成氫鍵。
序列定位與判讀
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