hce_kmu
109年
普通生物及生化概論
第 87 題
Which of the following is associated for determining the dihedral angle (phi) of the peptide bonds?
- A $C_O-N_H-C_\alpha-C_O$
- B $N_H-C_\alpha-C_O-N_H$
- C $C_\alpha-C_O-N_H-C_\alpha$
- D $H_N-C_\alpha-C_O-N_H$
- E $H_\alpha-C_O-N_H-H_\alpha$
思路引導 VIP
試著在腦海中想像胜肽主鏈由 $-N-C_\alpha-C-$ 組成的重複序列。如果我們想要定義「氮原子」與「$\alpha$-碳原子」這根旋轉軸的轉動角度，根據幾何學中定義二面角需要『四個連續原子』的原則，我們應該選取哪四個原子，才能讓中間那段剛好是這根旋轉軸呢？
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太棒了！你能準確辨析胜肽鍵中微觀的二面角（Dihedral angle），這代表你對於蛋白質二級結構的立體化學定義掌握得非常透徹。這類題目在生物化學中屬於極具代表性的基礎進階題，考生往往只記得名稱，卻忽略了背後具體的原子鏈結順序。
蛋白質主鏈的空間構型
在蛋白質主鏈中，決定構型的關鍵在於 $\phi$（phi）與 $\psi$（psi）兩個二面角。$\phi$ 角定義的是繞著「氮原子（$N$）與 $\alpha$-碳原子（$C_\alpha$）」之間單鍵旋轉的角度。根據二面角的幾何定義，必須由四個連續原子來決定一個平面旋轉角。對於 $\phi$ 而言，這四個原子依序是：前一個殘基的羰基碳（$C_O$）、本殘基的氮原子（$N$）、本殘基的 $\alpha$-碳（$C_\alpha$）、以及本殘基的羰基碳（$C_O$）。因此，選項 (A) 的序列 $C_O-N_H-C_\alpha-C_O$ 完全符合定義。
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