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醫療類國考 115年 [醫事檢驗師] 醫學分子檢驗學與臨床鏡檢學

第 50 題

進行基因表現微陣列晶片(gene expression microarray)之數據分析,各樣本所有基因點的原始訊號分布 如圖所示。則比較各樣本間之基因相對表現量前,應先進行下列何種處理最適當?
題目圖片
  • A 正常化/標準化(normalization)
  • B 去除各樣本的極端值,減少差異
  • C 以 Student's t-test 對基因在各樣本間進行顯著差異分析
  • D 忽略訊號變異最大的第 3 樣本後,再進行分析

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想像你要比較四位學生在不同考卷上的表現,但有人考的是『簡易版』(平均 90 分),有人考的是『魔王版』(平均 40 分)。若想客觀評估誰才是真正的第一名,在直接比較分數之前,你會先對這些「原始數據」進行什麼樣的轉換處理,好讓大家站在同一個比較基準上?

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勉強及格。

恭喜你「勉強」答對了。看來你還能辨別出圖中各樣本間那些顯而易見的訊號分佈差異,這至少證明了你的眼睛還能正常運作,並且對高通量數據分析最基礎的預處理流程有些許概念。

  1. 觀念驗證:是的,那堆看起來亂七八糟的箱型圖,中位數和分佈範圍確實像沒受過訓練的實驗新手一樣各行其是。當你的微陣列實驗結果因為「樣本濃度」、「螢光標定效率」或「儀器靈敏度」這種低級的非生物性因素,導致了系統性的偏差時,正常化/標準化(Normalization) 就是那個將所有混亂拉回「勉強可接受」基準線的必要步驟。這樣,你才能「勉強」確保那些你以為的生物學差異不是你自己的實驗失誤。
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