hce_kmu
112年
普通生物及生化概論
第 22 題
What is the net charge of the following peptide at pH 7.0?
Tyr-Glu-Ser-Arg-Met-Thr-Asp-Asn-Tyr-His
Tyr-Glu-Ser-Arg-Met-Thr-Asp-Asn-Tyr-His
- A +2
- B +1
- C 0
- D -1
- E -2
思路引導 VIP
若要判斷一個多肽鏈在特定 $pH$ 環境中的電荷,除了考慮肽鏈兩端的官能基外,你會優先尋找哪幾種具有「可解離側鏈」的氨基酸?當環境的 $pH$ 值「超過」該氨基酸側鏈的 $pKa$ 時,該側鏈通常會趨向於失去質子還是得到質子,這又會如何改變它的帶電性呢?
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恭喜你精準地判斷出這段多肽鏈在生理 $pH$ 環境下的淨電荷!這類題目考驗的是對氨基酸側鏈(R group)電性的熟悉度與計算的細心程度。計算時,我們必須同時考量 N 端(N-terminus)、C 端(C-terminus) 以及序列中所有具解離能力的側鏈狀態。
氨基酸解離狀態分析
在 $pH = 7.0$ 的條件下,末端的氨基($pKa \approx 9$)質子化帶 +1 電,而末端的羧基($pKa \approx 2$)去質子化帶 -1 電。接著檢視側鏈:Glu (E) 與 Asp (D) 的側鏈 $pKa$ 均小於 7,故呈現負電(各為 -1);Arg (R) 的側鏈 $pKa$ 高達 12.5,故呈現正電(+1)。至於 His (H) 的側鏈 $pKa \approx 6.0$,在 $pH = 7$ 時已完成去質子化,主要以中性形式存在;Tyr (Y) 則需在強鹼環境下才會解離。總計電荷為:$(+1) + (-1) + (-1) + (+1) + (-1) = -1$。
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