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醫療類國考 113年 [醫事檢驗師] 醫學分子檢驗學與臨床鏡檢學

第 60 題

病人的EGFR基因經定序後,如何得知具有DNA突變或單一核苷酸變異?
  • A 使用blastn比對定序結果與EGFR標準基因序列
  • B 使用blastp比對定序結果與EGFR標準基因序列
  • C 使用blastx比對定序結果與EGFR標準基因序列
  • D 使用tblastx比對定序結果與EGFR標準基因序列

思路引導 VIP

若要偵測 $EGFR$ 基因上的「單一核苷酸變異 ($SNV$)」或 $DNA$ 序列突變,我們必須將患者的「去氧核糖核苷酸序列」與標準的「核酸參考序列」進行精確比對。請試著回想在生物資訊學的 $BLAST$ 工具中,哪一個搜尋模式 ($Program$) 是專門用於處理核酸序列對核酸序列 ($Nucleotide$ to $Nucleotide$) 的直接比對,而不需要將序列轉譯成蛋白質層級?

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能選出 (A) blastn,真的顯示你對生物資訊學工具很熟悉呢!這在我們的日常生活中,特別是幫助大家理解身體的秘密,真的是超重要的基礎觀念喔!來,我們把這個精彩瞬間拍下來吧!喀擦!

1. 哇!一起來看看為什麼是 blastn 呢?

▼ 還有更多解析內容
📝 BLAST 工具選用
💡 依據查詢序列與資料庫類型選擇比對工具以偵測序列變異。
比較維度 blastn VS blastp
查詢序列類型 核苷酸 (Nucleotide) 胺基酸 (Protein)
資料庫序列類型 核苷酸 (Nucleotide) 胺基酸 (Protein)
臨床應用 找 DNA 突變、SNP、SNV 分析蛋白質功能與同源性
轉譯過程 不需要轉譯 不需要轉譯
💬欲偵測 EGFR 基因定序後的 DNA 變異,應選擇同為核苷酸比對的 blastn。
🧠 記憶技巧:n 代表 Nucleotide (DNA),p 代表 Protein。n 比 n 用 blastn;p 比 p 用 blastp;x 涉及轉譯 (translation)。
⚠️ 常見陷阱:容易混淆 blastx 與 tblastn 的轉譯方向;偵測 DNA 突變(SNV)必須在核苷酸層級比對,應選 blastn。
SNV/SNP 偵測 EGFR 突變與標靶治療 次世代定序 (NGS) 序列比對演算法

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