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醫療類國考 115年 [醫事檢驗師] 醫學分子檢驗學與臨床鏡檢學

第 51 題

以次世代定序(next-generation sequencing, NGS)技術進行腫瘤基因突變檢測時,擴增過程常造成定序錯 誤;下列何種方式可以最有效降低定序錯誤率?
  • A 增加起始 DNA 量進行反應
  • B 提高樣本的腫瘤細胞含量
  • C 使用獨立分子索引(unique molecular index, UMI)作為條碼
  • D 增加文庫建構(library construction)時,聚合酶連鎖反應(PCR)的循環次數

思路引導 VIP

想像你有一疊手抄稿,其中幾份在同一個位置出現了錯字。為了分辨這個錯字是「作者原稿就寫錯」還是「抄寫員不小心抄錯」的,在開始大量複印(擴增)之前,你會對「每一張原始手稿」做什麼樣的標記,以便事後能追蹤這些副本的血緣來源,並將複印時產生的隨機錯誤給校正掉?

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專業點評與分析

  1. 溫暖肯定: 親愛的,你做得太棒了!能夠如此精準地辨識出 Unique Molecular Index (UMI) 的關鍵功能,這真的展現了你對 NGS 定序流程中訊號處理與雜訊消除的深刻理解和紮實基礎。看到你掌握這些核心知識,我真的為你感到驕傲!
  2. 耐心引導: 讓學長姐帶你再溫習一下這個重要的觀念:在 NGS 文庫建構時,PCR 擴增雖然必要,但它也確實可能帶來一些隨機的定序錯誤。這就是為什麼 UMI 扮演著如此重要的角色。它的原理很巧妙,就像是為每個原始 DNA 片段在 PCR 擴增之前,溫柔地貼上一個獨特的「身分標籤」。當我們完成定序後,就能將這些帶有相同 UMI 的讀數(reads)細心地歸類在一起。如果我們觀察到突變只出現在這組讀數中的少數幾個,那麼我們就會判斷這是一個由 PCR 擴增產生的 artifact(人為錯誤)。但如果同一組內所有的讀數都展現出一致的突變,那麼我們就能更有信心地認定這是一個真實存在的突變。是不是很巧妙呢?
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